《菩提樹(shù)下》故事發(fā)生在清朝末年當(dāng)時(shí)淮河瘟疫肆虐龍大爺與結(jié)拜金蘭方秀才赴疫區(qū)救治卻發(fā)現(xiàn)此疫為人禍兇手是與大奶奶（陳莎莉 飾）通奸的龍二爺（李子雄 飾）二爺不念手足之情聯(lián)手大奶奶將胞兄殺死然后嫁禍方秀才方夫人逃命途中錯(cuò)抱龍二私生子數(shù)年后龍家后代被關(guān)家收養(yǎng)取名厚樸（鐘漢良 飾）他成長(zhǎng)于懸壺濟(jì)世的關(guān)家自幼學(xué)會(huì)了慈悲為懷而方家之子舞笙（劉愷威 飾）則嬌生慣養(yǎng)成了少爺他倆都對(duì)鏡心（呂一 飾）產(chǎn)生愛(ài)意而鏡心則更頃心于厚樸龍家的蓮生（楊蕊 飾）也是非厚樸不嫁但她并不知道厚樸是她的親哥哥就在這時(shí)方秀才妻子回來(lái)了她要討回當(dāng)年死去的冤魂......